Image J - Initiation

• Action régionale
• PDF
•   Techniques spécifiques
•    Jean-François GILLES , Vincent CONTREMOULINS , Olivier LEROY

Objectifs

• Découvrir les possibilités du logiciel Image J
• Acquérir les bases du traitement et de l’analyse des images numériques en biologie
• Introduction au principe des macros

NB : Le contexte sanitaire nous contraint à limiter le nombre de participants aux sessions de formation. Dans l’éventualité où  la formation serait proposée à distance, vous serez immédiatement contacté.e. 

Public

Chercheurs, Ingénieurs, techniciens, doctorants désirant s'initier à l'analyse d'Images

Programme

1/ L’image numérique en microscopie :

• La chaine d’acquisition d’images en biologie
• Résolution et échantillonnage en microscopie
• Formats d’images
• Stacks et Hyperstacks

2/ Visualisation d’image :

• Histogrammes
• Palettes de couleurs
• Reconstructions 2D/3D

3/ Analyse quantitative des images numériques en biologie :

• Régions d’intérêt (ROI)
• Seuillage
• Filtres morphologiques
• Comptage d’objets
• Colocalisation

Les macro-commandes : quelques macro-commandes utiles

A savoir : Il est recommandé aux participants d’apporter leurs images

Méthodes pédagogiques

Alternance d’apports théoriques et d’exercices pratiques