Image J - Initiation

  • Action régionale
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  •   Techniques spécifiques
  •    Jean-François GILLES , Vincent CONTREMOULINS , Olivier LEROY

Objectifs

  • Découvrir les possibilités du logiciel Image J
  • Acquérir les bases du traitement et de l’analyse des images numériques en biologie
  • Introduction au principe des macros

 

NB : Le contexte sanitaire nous contraint à limiter le nombre de participants aux sessions de formation. Dans l’éventualité où  la formation serait proposée à distance, vous serez immédiatement contacté.e. 

Public

Chercheurs, Ingénieurs, techniciens, doctorants désirant s'initier à l'analyse d'Images

Programme

1/ L’image numérique en microscopie :

  • La chaine d’acquisition d’images en biologie
  • Résolution et échantillonnage en microscopie
  • Formats d’images
  • Stacks et Hyperstacks

 

2/ Visualisation d’image :

  • Histogrammes
  • Palettes de couleurs
  • Reconstructions 2D/3D

 

3/ Analyse quantitative des images numériques en biologie :

  • Régions d’intérêt (ROI)
  • Seuillage
  • Filtres morphologiques
  • Comptage d’objets
  • Colocalisation

 

Les macro-commandes : quelques macro-commandes utiles

A savoir : Il est recommandé aux participants d’apporter leurs images

Méthodes pédagogiques

Alternance d’apports théoriques et d’exercices pratiques

 

Sessions passées 2

Lundi 17 Mai 2021
Mercredi 27 Octobre 2021

Partenaires

CNRS

Informations pratiques

IFSeM Formation
7, RUE GUY MÔQUET
94800 VILLEJUIF