Bio-statistiques en expérimentation animale

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•   Connaissances scientifiques

Objectifs

Les objectifs APAFIS
Réfléchir, penser le design expérimental avant d'expérimenter
Connaître la taille de l'effet et les risques, définir les seuils : dimensionner N

Public

Chercheurs-Ingénieurs-techniciens et doctorants : tous les personnels des laboratoires qui conçoivent et /ou appliquent les procédures expérimentales (concepteurs, applicateurs...) et devant satisfaire à l’obligation de formation (3 j tous les 6 ans)

Programme

La démarche scientifique
Estimation
Mesure = signal + bruit + biais

Les statistiques
Moyenne, écart type ; médiane, MAD
Design expérimental
Randomiser les effets non contrôlés ou non identifiés
Identifier et maîtriser les effets confondants
P-value, Puissance et calcul de N avec GPower
Connaissances préalables
Distribution des valeurs et de la moyenne d'un échantillon
Animation d'un échantillon
Représentation d'un échantillon et cas non gaussien
Grille de tests statistiques et typologie des variables

Tests paramétriques ou non et leur conditions d'application
Correction de la multiplication du risque

Tests non paramétriques
Pas de conditions d'application, vraiment ?

Tests par permutations
Typologie des expériences
Analyse de données
Valeurs extrêmes : Enlever ou pas
Transformer les données
Effet non linéaire, de seuil et effet multiplicatif, additif…
Linéariser, stabiliser la variance
Interprétation
Taille d'effet dans la vie courante

Exemples

Ressources :Livres Howell, Articles Nature Methods, Logiciels GPower, Liens Web

Méthodes pédagogiques

Exposés théoriques
Interactions entre les intervenants et les stagiaires