Méthodes d’analyse protéomique comparative globale

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•   Connaissances scientifiques

Public

Chercheurs, enseignants-chercheurs, ingénieurs et techniciens engagés ou souhaitant s’engager très prochainement dans un projet d’analyse protéomique comparative.

Programme

Programme

• Rappel sur la biochimie des protéines
• Généralités sur l’analyse protéomique :
• Buts de l’analyse protéomique (identification, quantification)
• Spectrométrie de masse : principes généraux
• Workflow d’une analyse protéomique comparative globale de la préparation des échantillons à l’analyse des résultats :
• Conseils pour la préparation des échantillons biologiques
• Recherche de modifications post-traductionnelles
• Recherche de partenaires protéiques
• Principales techniques de protéomique quantitative (iTRAQ,SILAC,Label Free)
• Identification et quantification des protéines à l'aide du logiciel MaxQuant
• Rappel en statistiques
• Traitement des résultats à l’aide du logiciel Perseus : présentation des différentes fonctions du logiciel
• Analyses Fonctionnelles : enrichissement de termes, réseaux d'interaction
• Analyse des données de protéomique des participants (lors de la ½ journée)

Il est recommandé d’apporter un PC sous W10 ou W11